ファーストシーズン
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新型モビルスーツ（以下“MS”）の公開軍事演習を行っていたAEUは、突如所属不明のMS2機の襲撃を受ける。額に“GUNDAM”と刻印されたそれらの機体は、圧倒的な機動性と攻撃力でAEUのMSを破壊していった。同じころ、人類革新連盟の宇宙ステーションを襲撃したテロリストを、同様の刻印が施された別の2機が迎撃し、多数の市民の命が救われた。
この騒動にメディアが沸き立つ中、世界に向けて1つの声明が発表される。4機のMS「ガンダム」を所有する私設武装組織「ソレスタルビーイング（以下“CB”）」は、戦争・内乱など世界中のあらゆる武力紛争に同じ武力をもって介入し、戦争根絶を目指す集団であるという。それは「平和のための武力行使」という矛盾を抱える行為であった。
莫大なエネルギーを生み出す"太陽炉"を搭載した4機のガンダムを操るのは、刹那、ロックオン、アレルヤ、ティエリアら4人のガンダムマイスター達。武力介入を行ないながらも、その最中にも人命救助を行なうなど、彼らの存在に世界は混乱。存在を否定するかのごとくテロが起きる一方、彼らを正義だと称える声も有り、賛否両論が巻き起こる。また普通の学生であった沙慈も世界の変革に巻き込まれるのであった。
各国家群は己の威信をかけ、ガンダムを手に入れようと様々な作戦を実行するが、ガンダムとの性能差の前にことごとく敗北、CBは着実に武力介入を実行していった。そうした中で、各国家群は合同軍事演習を名目に、大規模なガンダム鹵獲作戦を決行。圧倒的な物量を前に遂にガンダムも敗北するかと思われたその時、計画には存在しないトリニティを名乗る新たなガンダムマイスター達の登場により計画が綻び始める。彼らによって窮地を救われた刹那達だったが、虐殺ともいえる過剰な武力介入を行なう彼らに疑念を抱く。またCBの監視者であるはずのアレハンドロの裏切りによって各国家は"擬似太陽炉"を手に入れ、 CBを凌ぐ軍事力を手に入れた。
実はトリニティもアレハンドロが世界を支配するための布石でしかなく、既にトリニティは排除され、計画の要であった演算処理システムの『ヴェーダ』も掌握されたことにより、刹那たちも同じく排除されるだけとなってしまった。
そして遂に行なわれる国連軍のガンダム殲滅作戦[4]。CBの計画は破綻し、仲間を次々と失いながらも、戦いの果てに平和があると信じ、刹那達は最終決戦へと挑む。
セカンドシーズン
4年が経過した西暦2312年。全ての軍が国連軍として統一され、世界は一つになったかに見えた。しかしその裏では、独立治安維持部隊『アロウズ』によって、反政府組織や主義・思想への弾圧や虐殺が行なわれ、今なお世界は歪んだままであった。
夢を叶えて宇宙技術者にとなった沙慈はアロウズによる弾圧に否応無く巻き込まれ、国連軍との決戦を生き延び刹那は歪んだままの世界に立ち上がり再び戦いへと身を投じる。そして二人は再び邂逅した。
沿革と展開
本作はガンダムシリーズの通算12作目（『SDガンダムフォース』を含む）に当たり、テレビ放映では初めて前期（ファーストシーズン、25話分）・後期（セカンドシーズン、25話分）の分割放送を行う。ファーストシーズンは2007年10月6日から2008年3月29日まで、MBS・TBS系列「土6」枠（一部地域遅れネット）にて放送された。
また、ガンダムシリーズおよび「土6」枠作品初のハイビジョン制作・放映となる。セカンドシーズンは2008年10月5日から2009年3月29日までMBS・TBS系列「日曜午後五」枠（全国地域同時ネット）にて放送された。また、2010年には劇場映画版『機動戦士ガンダム00（仮称）』が公開予定である。
ソレスタルビーイング あらすじも参照
西暦2100年頃に科学者イオリア・シュヘンベルグによって創設された。英字表記で「Celestial Being」すなわち「天上人」の名を持つ。構成員は守秘義務により互いの素性を秘匿しており、互いをコードネームで呼び合う（一般的にキャラクターの名称として扱われるのはこのコードネームの方である）。また、構成員の中でも特にガンダムのパイロットは「ガンダムマイスター」と称される。2ndでは、構成員は色違いや多少の形の違いはあれど、統一されたデザインの制服を着用している。
公式外伝
テレビ放映と並行して、電撃ホビーマガジン、ガンダムエース、月刊ホビージャパンの3誌にて、本作を別の視点から描くサンライズ公式の外伝が展開される。各作品は、それぞれアニメ本編の過去・現在・未来からの回想が描かれており、他のガンダムシリーズ作品におけるMSV系作品と同様、アニメ本編に登場するMSのバリエーション機が多数登場している。
複数の作家の手で複数の雑誌に展開されているが、その全てを統括するのは千葉智宏であり、彼のシナリオに基づいて全てのストーリーが有機的に関連している。
機動戦士ガンダム00P
電撃ホビーマガジンにて連載。ショートストーリーを、連載回ごとに登場するメカニックの解説や模型作例を使用したジオラマを交えて掲載する。
本編から遡ること15年前。まだ人々がCBの存在を知らない時代に、第2世代ガンダムマイスター達の手によって、その象徴たるMS「ガンダム」の開発が行われていた。
エクシアの前型機である「アストレア」を始めとする「第2世代型ガンダム」の開発系譜にまつわるストーリー。ある時期を境に2ndシーズンへと移行し、第3世代ガンダムマイスターのスカウトや、第3世代型ガンダムの開発史を中心としたストーリー展開となってゆく。
機動戦士ガンダム00F
月刊ガンダムエースにて連載。ときた洸一作画によるコミック作品。 西暦2307年。満を持して活動を開始したCBと共に、彼らを支援するもう一つの組織「フェレシュテ」も活動を開始した。 主人公フォン・スパークを始めとする作品オリジナルのキャラクターの他、他作の登場人物やメカニックなども登場する。
機動戦士ガンダム00V
月刊ホビージャパンにて連載。『00P』同様、ショートストーリーと模型作例を中心とした構成である。 『00』本編よりも更に先の時代の物語。テレビ本編では語られなかったミッションとそこで用いられたメカニックについて、とある歴史研究者と、一人のエースパイロットの視点から見て語られるストーリー。
その他関連メディア
漫画
月刊マガジンZにて連載（2007年11月号プレ連載、12月号より本格連載）。田口央斗作画によるコミカライズ作品。 同様にケロケロエースでも連載。作画は大森倖三。
小説
角川スニーカー文庫から発売。著者は木村暢。イラストは米山浩平、柳瀬敬之、羽音たらく、鷲尾直広（2巻のみ）。 1. 機動戦士ガンダム00(1) ソレスタルビーイング 2008年4月1日初版発行 ISBN 978-4-04-473601-9 2. 機動戦士ガンダム00(2) ガンダム鹵獲作戦 2008年8月1日初版発行 ISBN 978-4-04-473602-6 3. 機動戦士ガンダム00(3) フォーリンエンジェルス 2008年11月1日初版発行 ISBN 978-4-04-473603-3 4. 機動戦士ガンダム00セカンドシーズン(1) 天使再臨 2009年3月1日初版発行 ISBN 978-4-04-473604-0
ゲーム
下記の2作品はバンダイナムコゲームス（バンダイレーベル）より発売。 * 機動戦士ガンダム00 - ニンテンドーDS用ソフト。2008年3月27日発売。 * 機動戦士ガンダム00 ガンダムマイスターズ - プレイステーション2用ソフト。2008年10月16日発売。
クロスオーバー作品
* ガンダムウォー - トレーディングカードゲーム。ファーストシーズン放映に先駆けて本作品からも登場した。 * 機動戦士ガンダム ガンダムVS.ガンダム - 対戦アクションゲーム。ガンダムエクシアが隠し機体として参戦（ゲームシステムの一環としてガンダムデュナメス・ガンダムヴァーチェ・ガンダムキュリオスも登場）[66]している。ただしトランザムシステムは製作時期の関係上搭載されていない（セカンドシーズン放送中に発売されたPSP版でも搭載されていない）。
* 機動戦士ガンダム ガンダムVS.ガンダム NEXT - 2009年3月稼働のアーケードゲーム（対戦アクションゲーム）。ガンダムエクシアに加えてガンダムヴァーチェも参戦（ゲームシステムの一環としてガンダムデュナメス・ガンダムキュリオスも続投）。対戦ステージとして「軌道エレベータ ラ・トゥール」、戦闘中のBGMとして「Ash Like Snow」が収録。エクシアにはトランザムシステムが装備され、ヴァーチェは原作通りパーツをパージしてナドレになれる。
ドラマCD
企画制作はサンライズ。販売はJVCエンタテインメント。 機動戦士ガンダム00 アナザーストーリー MISSION-2306 2008年7月23日発売。ファーストシーズンと同じ世界を舞台としているが、作風はアニメと打って変わり非常にバラエティー色が強いコメディー作品となっている。声優コメントではキャストの多くが、そのあまりの差に困惑している様子が収録されている。エクストラドラマ『ハレルヤの日』も収録されている。
あらすじ アナザーストーリー MISSION-2306
西暦2307年。ガンダムマイスターたちに、潜入任務がヴェーダにより課せられる。目的はある事情により犯罪組織に身柄を狙われるルイス・ハレヴィの護身。刹那は学生達に溶け込むため、21世紀初頭の軽い若者を装い潜入するも護衛対象に警戒されてしまう。さらに担任のハム先生に一目惚れされてしまい任務は難航。増援として女学生に扮したティエリアや、催眠術で喧嘩番長となったアレルヤが駆けつけるも任務は失敗。ルイスは犯罪組織に誘拐されてしまう。マイスター達はグラハムに犯罪組織とのつながりを疑うが、怪しく見えた彼は軍の上級大尉であった。謎の変態教師グラハムとマイスター達の喜劇が描かれる。
ハレルヤの日
ガンダムマイスター達の手緩い作戦行動に痺れを切らしたハレルヤが暴走してしまう。持ち前の性技を持ちいて、スメラギやヴェーダを籠絡。メンバーの反発を押しのけ、独自作戦を遂行してしまう。
機動戦士ガンダム00 アナザーストーリー ROAD TO 2307
2008年9月24日発売。刹那がプトレマイオスへ合流した直後を描いたエピソード『天使降臨』と、フラッグのテストパイロット時代のグラハムのエピソード『ユニオンフラッグ』の2つが収録されている。
あらすじ 天使降臨
武力介入を開始する2年前。刹那はプトレマイオスへ合流し、メンバー達はその若さに驚いていた。一方ティエリアは、ヴェーダに情報のなかった刹那の存在に疑問を抱き、その実力を見極めるため、模擬戦を行うことになる。
ユニオンフラッグ
若いながらも優秀なパイロットとして、フラッグのテストパイロットとなったグラハム。その対抗機体のテストパイロットはかつての上官だった。グラハムが「上官殺し」と呼ばれる経緯が描かれている。
ラジオ
ソレスタルステーション00を参照
その他書籍グ
* 機動戦士ガンダム00 メカニック-1st ISBN 978-4575464429グ
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